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DTA(Diphtheria Toxin A)負篩選基因是一種常用的遺傳工程工具,主要用于剔除未發(fā)生特定重組事件的細胞。這種技術依賴于白喉毒素A鏈(DTA),它能抑制蛋白質合成并導致細胞死亡。在基因打靶實驗中,DTA通常被用來作為負篩選標記,以確保只有那些經歷了正確同源重組的細胞才能存活下來。
作用機制:DTA編碼的是白喉毒素的一個亞單位,該毒素能夠阻斷真核生物中的蛋白質合成過程。當DTA表達時,它可以殺死含有它的細胞,除非這些細胞具備抵抗此毒性的能力。
應用背景:在構建轉基因動物或細胞系的過程中,研究人員常常需要篩選出發(fā)生了精確DNA整合的細胞。為了做到這一點,除了使用正篩選標記如neo等來選擇成功導入外源DNA的細胞之外,還會利用到DTA這樣的負篩選標記來淘汰那些沒有正確整合目標DNA的細胞。
在CRISPR-Cas9介導的全基因組敲除文庫篩選中,DTA可以與TK(胸苷酸激酶)一起用作報告系統的一部分,幫助識別參與天然免疫信號通路調控的關鍵宿主基因。
通過將DTA置于特定啟動子控制之下,比如IFNβ啟動子區(qū)域的最佳截短版本,可以在病毒感染后誘導EGFP或者zi殺基因TK和DTA的表達,從而實現對相關基因的功能性篩選。
提高特異性:由于DTA能夠有效清除不希望出現的隨機整合事件,因此它有助于增加最終獲得的目標克隆群體中的正確重組體比例。
增強效率:結合其他篩選方法(例如G418抗性篩選),DTA負篩選可以幫助快速縮小候選細胞株范圍,減少后續(xù)分析所需的工作量。
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